Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms