Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPEGQ15772 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms