Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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