Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms