Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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