Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL4BQ13620 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
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