Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TROQ12816 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TROQ12816 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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