Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4DQ08499 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms