Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP3CAQ08209 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP3CAQ08209 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms