Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PIGFQ07326 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms