Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms