Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms