Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms