Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms