Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms