Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms