Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP9P55211 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP9P55211 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP9P55211 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP9P55211 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP9P55211 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP9P55211 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP9P55211 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP9P55211 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP9P55211 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP9P55211 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP9P55211 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP9P55211 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP9P55211 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP9P55211 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP9P55211 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP9P55211 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP9P55211 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms