Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms