Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms