Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
BMI1P35226 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
BMI1P35226 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
BMI1P35226 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
BMI1P35226 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
BMI1P35226 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
BMI1P35226 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
BMI1P35226 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
BMI1P35226 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
BMI1P35226 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
BMI1P35226 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
BMI1P35226 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
BMI1P35226 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
BMI1P35226 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
BMI1P35226 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BMI1P35226 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BMI1P35226 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BMI1P35226 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BMI1P35226 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BMI1P35226 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BMI1P35226 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BMI1P35226 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BMI1P35226 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BMI1P35226 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BMI1P35226 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms