Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJB2P29033 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJB2P29033 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJB2P29033 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms