Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBL1P28749 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBL1P28749 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RBL1P28749 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms