Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VEGFAP15692 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms