Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRCP08575 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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