Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYBBP04839 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms