Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POP4O95707 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POP4O95707 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POP4O95707 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms