Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL3O95573 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL3O95573 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms