Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPLO60437 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPLO60437 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPLO60437 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPLO60437 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPLO60437 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPLO60437 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPLO60437 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPLO60437 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPLO60437 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPLO60437 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPLO60437 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPLO60437 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PPLO60437 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PPLO60437 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PPLO60437 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPLO60437 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPLO60437 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPLO60437 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPLO60437 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPLO60437 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPLO60437 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPLO60437 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPLO60437 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPLO60437 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPLO60437 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPLO60437 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPLO60437 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPLO60437 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms