Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP104O60308 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms