Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPAG9O60271 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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