Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SDR42E2A6NKP2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms