Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPIPB13A6NJU9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms