Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBA6A0AVT1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms