Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNPO3Q9Y5L0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms