Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS11EQ9UL52 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms