Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms