Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms