Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms