Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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