Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF6Q9BYE7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms