Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms