Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms