Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF12Q99081 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms