Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CDRT15Q96T59 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms