Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HPS3Q969F9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms