Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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