Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF548Q8NEK5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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