Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms