Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms