Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms